현대 산업의 생산 공정은 갈수록 엄격한 품질관리가 요구되므로 최근 가장 심각한 생산장애로 문제시 되는 부분이 먼지, 파티클로 인한 오염 및 불량문제입니다. 먼지, 파티클로 인한 불량 문제는 대부분 제품 표면에 이물질이 들러붙어 제품을 오염시키는 현상으로서 이를 방지하기 위해 작업장 환경을 먼지, 파티클이 없는 크린룸으로 개조해야 합니다.

산업용 크린룸은 반도체 산업 뿐만이 아니라 정밀기기, 광학기기, 자기테이프나 사진용 필름, 인스턴트 식품의 제조와 포장, 특수인쇄 등, 각각의 공정에 따라 요구되는 청정도는 다릅니다. 따라서 크린룸을 설계할 때에는 목적과 용도에 따라 설계하여야 하며, 취급 물품과 생산 제품을 고려하여 제작해야 합니다. 그리하여 크린룸 내에서는 air shower나 pass bos를 통한 출입을 하여 외부로부터의 먼지, 파티클의 유입을 방지하며, 각 공간에는 공기의 역류 등을 방지하기 위하여 damper를 사용하여 효율적인 청정도 유지를 기하여야합니다.

바이오 클린룸(Bio Clean Room, 약칭 BCR)은 생물학적 오염이 제어되는 청정실을 말합니다. 미생물을 제어대상으로 하는 BCR(Bio Logical Clean Room)은 의약품 제조 공정의 GMP(Good Manufacturing Practics : 우수 의약품의 제조 관리 기준)와 병원 수술실에서의 무균화의 필요성에 의해 발전해 왔습니다.
또한 식품, 화장품 산업에서도 점차 GMP에 준하는 Clean Room이 적용되고 있으며 이미 레토르트 식품, 저장기간이 긴 식품(간장, 된장, 햄, 소시지 등)의 제조 공정과 주류와 음료 충전 공정 등에서는 크린룸이 적용되고 있습니다. 바이오 크린룸의 응용 분야는 아래의 표와 같이 제약에서 비롯하여 병원의 수술실 또는 입원실, 실험동물 사육실, 식품제조공정, 화장품, 농업 등의 청정실과 실험자에 대한 감염방지나 오염원의 실험실 외부로의 유출을 방지하는 바이오 헤저드(Bio Hazard) 시설 등에 폭넓게 응용되고 있습니다.

최근 병원에서는 원내감염, 수술중이나 수술후의 2차 감염, 더 나아가 환경오염의 관점 에서 미생물 제어문제가 중요한 과제 중 하나로 다루어지고 있습니다. 특히 면역 억제제 의 영향으로 감염에 민감해진 환자나 항암제 투여환자, 백혈병 환자 등의 병실이나 화상 치료중인 환자, 신생아실 등도 청정실이 이용됩니다. 근래에는 병원 내 감염의 증가로 인해 병원 전체가 청정실화 해 가고 있습니다.

신의약품의 연구나 약효검증을 할때 인체에 직접 임상하기 전에 동물시험을 하게 되며 이를 전임상시험이라고 합니다. 동물 종류별 온 · 습도 및 환기조절이 필요하며 감염의 방지 등을 위해 청정실 기술이 응용됩니다.
공기청정방식은 격리기(Isolator), 차단시스템(Barrier System), 개방시스템(Open System) 등 차압의 활용이고 HEPA Filter를 활용한 난류형이 주종을 이룹니다. 배기측에 오염방지를 위한 바이오 헤저드 시설이 있어야 하고, 전체적으로 소음이 적고 무정전 완전 가동을 위한 시설이라야 되며 이 규격은 각국마다 GLP(Good Laboratory Practice)에 관리됩니다.

식품 공장에서의 바이오 크린룸 기술은 가공식품의 제조 공정 중 열 멸균시에 식품의 고유풍미나 영양가의 상실을 방지하기 위하여 필요하며, 특히 방부제의 사용이 기피 되는 현실에서 미립자와 미생물의 오염을 관리하기 위해 청정기술을 응용하고 있습 니다. 미국을 위시하여 각국에서 식품 공장의 제조 관리 기준으로 HACCP(Hazard Analysis and Critical Control Point 위해요소 중정관리기준)를 채용하고 있고 우리나 라도 점진적으로 시행되고 있습니다. 특히 가열가공후 개방 냉각 공정이나, 용기에 봉입하는 공정에서의 오염관리가 중요 하므로 안전하고 위생적인 실내환경을 조성할 수 있는 크린룸 시스템이 필요합니다.